6S РНК одна из первых идентифицированных и секвенирован некодирующих РНК. Ее функция в бактериальнвй клетке была неопределенной до недавнего времени. РНК состоит из 184 нуклеотидов, трехмерная структура РНК является большой «шпилькой», содержащий большой одноцепочечный фрагмент.

6S РНК ассоциюеться с РНК-полимеразы, содержащий в своем составе фактор специфичности сигма-70 (sigma70 specificity factor). Это взаимодействие блокирует экспрессию с сигма-70-зависимых промоторов в течение стационарной фазы. Гомологи 6S РНК недавно были идентифицированы в большинстве бактериальных геномов. Многие Грамм-положительных видов имеют по две копии 6S РНК. В Bacillus subtilis обе копии взаимодействуют с РНК-полимеразы с сигма-факторами и экспрессируются во время различных фаз роста. Во многих протеобактерий 6S РНК может быть образована из транскрипта кодирующего гомологичные формы E. coli YgfA белка, который вероятно является метенилтетрагидрофолат синтетазой. Различные версии 6S РНК в других бактериях. Экспериментально было доказано, что purD РНК мотивы перекрываются с 6S РНК.

Изображения по теме

  • 6S SsrS РНК