Г

Генетическое расстояние

Генетическое расстояние — мера генетической различия (дивергенции) между видами, подвидами, или популяциями одного вида. Малая генетическое расстояние означает генетическое сходство, большая генетическое расстояние означает отдаленную генетическое сходство.

Существует много параметров, используемых для измерения генетической расстояния. В простейшем случае генетическое расстояние между двумя популяциями одного вида может быть определена как разница в частотах определенного признака. Например, частота резус-отрицательных людей составляет 50.4% среди басков, 41.2% в Фрации и 41.1% в Великобритании. Генетическое расстояние между басками и французами составляет 9.2%, генетическое расстояние между французами и британцами составляет 0.1% для признаки резус-отрицательный. Генетическое расстояние по нескольким признакам может быть усредненная для вычисления полной генетической расстояния.

Меры генетической расстоянии

Существует несколько способов измерения генетической расстояния. Среди них стоит выделить следующие:

Индекс фиксации

Это общепринятый метод определения генетической расстояния. Он принимает минимальное значение 0 и максимальное 1. Значение 0 говорит о о генетической идентичности, а величина 1 говорит о том, что две популяции являются разными видами.

Согласно неодарвинистською концепцией, новый вид возникает в результате дифференциации любой популяции, относится к нему; точнее говоря, происходит постепенная дивергенция на уровне генофонда этой популяции и вида в целом. В основе этой дивергенции лежит постепенная замена одних аллелей определенных генов на другие. В процессе дивергенции двух популяций все меньшее количество генов имеет аллели, которые встречаются в обоих популяциях. Когда же закончится процесс образования нового вида, для всех генов существуют аллели, характерные только для одной из популяций. При этом генетическое расстояние становится равной единице и новый вид с морфологической точки зрения становится отличным от исходного. На практике для расчетов генетической расстоянии определяют частоту встречаемости в каждой популяции различных форм ряда белков (при этом необходимо, чтобы количество исследуемых белков была достаточным). Число этих форм для каждого конкретного белка соответствует числу аллелей гена, кодирующего данный белок. Расчет производится следующим образом. Представим себе, что для какого-то гена G существует i разных аллелей (1, 2, 3 и т. Д.). В популяции А эти аллели встречаются с частотой 1, а 2, а 3 … В популяции В эта частота соответствует b1, b2, b3 … Исходя из этого, можно вычислить степень генетического сходства данных популяций по данному гену: Генетическое расстояние

Это уравнение дает возможность вычислить нормализованную вероятность того, что два аллеля из разных популяций будут идентичными. Если провести подобные расчеты для n генов, принадлежащих обоим популяциям, то можно будет вычислить среднюю арифметическую величину для каждого из этих генов. Обозначим IaB. Можно также рассчитать величины E a 2 i (обозначим ее I a) и Eb 2 i (обозначим ее I b). В этом случае генетическое сходство между двумя популяциями будет описываться уравнением: Генетическое расстояние

Генетическое расстояние (D) будет исчисляться по следующей формуле: Генетическое расстояние

Если генетическое расстояние составляет 0,62 (именно такое расстояние между человеком и шимпанзе), то из 100 генов, принадлежащих генофонда обоих видов, 62 (то есть примерно 2/3) имеют аллели, принадлежащих только одному из них. Если же генетическое расстояние между двумя популяциями составляет 1, то 100% генов этих популяций имеют аллеля, принадлежащие к одному из них. Такое расстояние соответствует завершению постепенной дивергенции популяции исходного вида и окончательном отделению нового вида. Степень генетического различия между двумя подвидами, относятся к одному виду, соответствует генетической расстоянии, равном 0,17 -0,22. Генетическое расстояние между двумя видами-близнецами (т.е. популяциями, которые не отличаются по морфологическим признакам, но не является способными к скрещиванию) составляет 0,50-0,60.

Стандартная генетическое расстояние Нея

Этот метод определения генетической расстоянии базируется на предположении того, что генетическая разница возникает за счет мутаций и генетического дрейфа.

Индекс Кавалли-Сфорза и Эдвардса (1967)

Этот метод определения генетической расстоянии базируется на предположении того, что генетическая разница возникает только за счет генетического дрейфа

Индекс Рейнольдса, Вейра и Кокерхама (1983)

Этот метод определения генетической расстоянии базируется на предположении того, что генетическая разница возникает только за счет генетического дрейфа

Видео по теме

Показать больше

Похожие статьи

Добавить комментарий

Проверьте также
Закрыть
Кнопка «Наверх»
Закрыть
Закрыть