International Aging Research Portfolio (IARP) — англоязычная неприбыльная, свободно доступна система управления знаниями, которая сочетает информацию о грантах, публикации, конференции по естественным, общественных и поведенческих наук.

Кроме расширенного поиска и инструментов для визуального анализа трендов, система включает каталог исследовательских проектов, разбитый по категориям, относящихся к исследованию старения. Система использует автоматизированные алгоритмы классификации с элементами машинного обучения для распределения исследовательских проектов по соответствующим категориям. Каталог проверяется многими редакторами-экспертами в своих категориях и членами научно-консультационного совета. Председателем научно-консультационного совета Чарльз Кантор.

Обзор

Исследование старения — междисциплинарная область науки, охватывает многие области естественных, социальных и поведенческих наук, а исследовательские данные сильно распылены. Популярные ресурсы, вроде PubMed или Google Scholar, предоставляют доступ к старым и актуальных научных аннотаций и полнотекстовых публикаций. Однако существует мало ресурсов, объединяющих международные базы данных, научные публикации, аннотации к научным грантов и базы данных клинических исследований.

Аннотации к грантам обычно публикуются финансирующими организациями и предшествуют публикациям в рецензируемой литературе. Некоторые из экспериментов, описанных в аннотациях к грантам оказываются неудачными или не приводят к рецензируемых публикаций. Во избежание дублирования и поощрения научного сотрудничества важно иметь доступ ко всей доступной в мире грантовой информации чтобы отслеживать информацию о подобных проектах.

База данных IARP сочетает информацию о исследовательские гранты, рецензирование публикации и выданные заявки на патенты из многих источников. База данных применяет гибкие механизмы классификации проектов и инструменты для анализа взаимосвязей проектов и трендов. Система позволяет ученым проводить поиск по централизованной базе данных, классифицировать и категоризировать геронтологические проекты и анализировать аспекты финансирования по многим дисциплинам исследований. IARP разработана для совершенствования размещения и приоритезации ограниченного финансирования проектов, уменьшение дублирования проектов и повышения уровня научного сотрудничества, таким образом увеличивая прогресс науки и медицины в области знаний, которая быстро развивается.

Система IARP собирает данные по грантам из многих источников, включая Национальный институт здравоохранения США, Европейскую Комиссию, Канадские институты исследований в области здравоохранения, Национальный научный фонд США, Национальный совет исследований в области здравоохранения и медицины Австралии и публикацию аннотаций по лицензии базы данных MEDLINE. Результаты данных поиска могут быть представлены в виде графиков и диаграмм для анализа трендов. Одной из главных особенностей системы IARP является автоматическая и ручная классификация проектов исследований в структурированный каталог. Научно-консультационный совет IARP и редакторы-добровольцы, эксперты в своих категориях, классифицируют проекты из базы данных к соответствующим категориям. Эти вручную классифицированы проекты становятся выборкам для обучения автоматизированных алгоритмов классификации с элементами машинного обучения. Система IARP является модульной и портативной и может быть использована как платформа для построения других систем управления знаниями в области изучения старения.

Содержание

The International Aging Research Portfolio (IARP) предоставляет грантовую информацию от Национальных институтов здравоохранения США, Европейской комиссии, Национального научного фонда США, исследовательских советов Канады и Австралии и многих других источников. Она также содержит аннотации к статьям MEDLINE по лицензии Национальной медицинской библиотеки США. Команда добровольцев по развитию IARP работает непосредственно с издательствами и регулярно обновляет базу данных автоматически или вводя информацию, предоставленную на физических носителях.

Характеристики

Простой поиск

Простой поиск по IARP может быть осуществлено введением ключевых аспектов предмета в окно поиска. IARP переводит этот первичный поисковый запрос и автоматически добавляет поля имен, булевы операции и значительно улучшает поисковый запрос, в частности, совмещая (с использование оператору ИЛИ) слова текста.

  "Programmed Theory Aging" 

переводится как

  ("Programmed" ИЛИ "Theory" ИЛИ "Aging") 

Расширенный поиск

Расширенный поиск предоставляет пользователям возможность ограничивать критерии поиска по дате создания, области исследования или механизма финансирования. Кроме описания, каждый исследовательский проект содержит информацию о финансирующие организации, принимающей организации и главного исследователя. Он также сочетает проект с другими подобными проектами и механизмами финансирования.

Для эффективного использования возможностей расширенного поиска, пользователь должен обладать определенными знаниями в области исследования и использовать соответствующие и точные ключевые слова и ограничения. Форма позволяет пользователям указывать несколько значений для точного поиска данных.

[Ключевые слова]. Пользователи могут использовать булевы операции и маскировки для поиска информации в описании проекта и названиях полей.

Примеры поисковых запросов:

  "nerv * '' stem AND cell NOT embryonic '' accumulation amyloid alzheimers ' 

[Области исследования]. Пользователи могут ограничивать поиск, обираячы желаемые области исследований из дерева категорий.

[Теории старения]. Пользователи могут выбрать несколько значений из списка теорий старения. Кроме того, пользователи могут ограничить поиск по: финансовому году, номера проекта, главному исследователю, датам начала и конца проекта, принимающей и финансирующей организации, типа финансирования.

Тренды и инструменты

Сайт предоставляет набор инструментов для визуализации данных проекта в виде диаграмм, графиков и сравнительных таблиц. Интерфейс позволяет пользователям создавать двумерные графики и сравнивать финансирование исследований за годом, институты, университетом, главным исследователем, региону и категории.

Сводная статистика

Сводная статистика предоставляет комплексный анализ данных, хранящихся в системе. Она в деталях отражает текущее состояние проектов и публикаций: общее количество, количество классифицированных / классифицированных вручную, классифицированных как геронтологические, неклассифицированным. Отражает топ 50 активных, завершенных проектов по сумме финансирования, ведущих стран, штатов США, исследователей, финансирующих и принимающих организаций, также по сумме финансирования.

Инструменты

Система также включает в себя такие инструменты, как "Поиск грантодателей", "Кто есть кто", "финансирующие организации", "События биотехнологии" и "Интернет-конференции", которые находятся на разных стадиях разработки. Целью этих инструментов является предоставление исследовательском сообществу возможности определять организации, которые финансируют подобные научные проекты, определить возможных сотрудников и поиска веб-конференций, которые относятся к их научных интересов.

Классификация данных

Автоматическая классификация проектов

Автоматическая классификация используется для определения проектов, относящихся к исследованию старения, в пределах больших наборов данных и для классификации проектов в соответствующие семантических групп. Система использует два алгоритма классификации с элементами машинного обучения: метод опорных векторов (SVM) и циклический нейронно-сетевой анализ логических множителей (BFA).

Ручная классификация проектов

Поскольку современные алгоритмы автоматической классификации ограничены и требуют от каждой категории наличии достаточно большой выборки для обучения, система в значительной степени полагается на ручную классификацию редакторами-экспертами в своих категориях. Административный интерфейс редакторов категорий дает возможность членам научно-консультационного совета, директорам институтов и начальникам лабораторий курировать категории высшего уровня и делегировать управление категориями низшего уровня студентам старших курсов.

Поиск подобных грантов и публикаций

IARP имеет возможность автоматически определять подобные и аналогичные проекты в базе данных, используя алгоритмический анализ аннотаций к проектам, патентов и публикаций. Этот тип расширенного анализа помогает избежать дублирования проектов и перекрестного финансирования аналогичных программ, а также показывает пробелы в исследованиях для потенциального финансирования.

Другие ресурсы, которые используют базу данных IARP

Проект FundingTrends выполняет простой поиск по ключевым словам среди миллионов биомедицинских проектов, поддерживаемых основными финансирующими организациями мира. Также он показывает сумму финансирования проектов, содержащих ключевые слова, на каждый год.

Проект Aging.CC также использует базу данных IARP для простого поиска биомедицинских проектов.