П

Пептидная последовательность

Пептидная или аминокислотная последовательность — порядок, в котором аминокислотные остатки, соединенные пептидными связями, лежат в полипептидной цепи белка или пептида. Соответствии с общими правилами, пептидная последовательность пишется с N-конца, то есть конца, содержащий свободную аминогруппу, к C-конца, который содержит свободную карбоксильную группу. Пептидная последовательность часто называется белковой последовательности, если она представляет первичную структуру белка. В общем пептидная последовательность представляет собой первичную структуру всех белков на момент синтеза, однако через посттрансляционной модификации первичная структура несколько меняется с образованием зрелого белка.

Сейчас определено и записано в базу данных последовательностей и другие базы данных много пептидных последовательностей. Для этого может использоваться секвенирования белков, хотя во многих случаях пептидная последовательность может быть получена с помощью перевода с нуклеотидной последовательности соответствующего гена (в случае эукариот необходимо также реконструировать процесс сплайсинга). Обычно в базах данных для названий аминокислот для краткости используются однобуквенные сокращения.

Анализ пептидных последовательностей — полезный инструмент исследования белков. Для анализа последовательностей сейчас разработано много вычислительных инструментов. Например, длинные последовательности гидрофобных остатков часто указывают трансмембранные спирали. Эти спирали, в свою очередь, указывают, что этот белок является интегральным мембранным белком. Определенные остатки указывают на типы вторичной структуры, например, бета-листы или альфа-спирали. По анализу полной последовательности белка можно оценить его изоэлектрической точки.

Важным при анализе последовательностей также является сравнение последовательностей с уже известными. Похожие последовательности, особенно схожие мотивы последовательности, часто указывают на похожую функцию или совместное эволюционное происхождение. Большое число гомологов данного белка в различных биологических видах указывает на эволюционное сохранение и важность этого белка для организма.

Изображения по теме

  • Пептидная последовательность
Показать больше

Похожие статьи

Добавить комментарий

Кнопка «Наверх»
Закрыть
Закрыть