Афанасий Филимонович Шафонский (13 (24) декабря 1740 (17401224), поселок Сосница, теперь Черниговской области — 8 апреля (27 марта) 1811, г.. Чернигов) — украинский врач, историк, общественный деятель, один из основателей эпидемиологии в Российской империи, сын сосницкого сотника Черниговского полка.

С 1756 учился за границей, в университете города Галле получил степень доктора прав, в университете Лейдена — доктора философии и в Страсбурге доктора медицины (1763).

С 1770 работал в Москве, где первым распознал чумную эпидемию и вместе с Даниилом Самойловичем и Касияном Ягельського участвовал в борьбе с ней. Издал книгу «Описание в бывшей в Москве язвы и о всех средствах, употребленных для ее прекращения» (1 774) и составил медико-топографическое описание Москвы.

В 1781 вернулся в Чернигов. Сначала работал председателем уголовного суда, затем генеральным судьей.

На основе материалов, собранных Дмитрием Пащенко, написал в 1784-1786 справочную работу «Черниговского намесничества топографическое описание» (1851), выданную в Киеве после его смерти. В ней собраны многочисленные сведения по истории Украины, природы, хозяйства, населения, говоров украинского языка (первая попытка характеристики Украинский диалектов Черниговщины), социально-экономического положения, быта и здоровья Левобережной Украины второй половине 18 века.

27 марта 1811 Афанасий Филимонович умер. Похоронили его в Чернигове на кладбище Воскресенской церкви.