Ацидофильные бактерии (лат. Acidus — кислый и греч. Φιλος — друг) — бактерии-ацидофилы, то есть бактерии, способные развиваться в условиях значительной кислотности среды. К ацидофильных бактерий принадлежат уксуснокислые, некоторые молочнокислые и другие бактерии.

Среди ацидофильных бактерий важное практическое значение имеют ацидофильные палочки (Lactobacillus acidophilus), которые вызывают молочнокислого брожения в средах с молочным и другими видами сахара. Культура этих бактерий может быть получена с содержимого кишечника животных и используется для изготовления ацидофильного молока.