Кладогенез — процесс эволюционного расщепления видов в котором каждая из и ее меньшие ветви формируют мер, эволюционный механизм и процесс адаптивной эволюции, который ведет к развитию большего разнообразия сестринский организмов. Этот процесс чаще всего происходит тогда, когда несколько организмов попадают в новые условия окружающей среды, или когда изменения навколишньго среды вызывают вымирания групп организмов, освобождая экологические ниши для групп выживших.

Современным примером кладогенез есть эволюционные события на Гавайских островах. Организмы попадают на эти острова с помощью океанических течений и ветров. Большинство видов на этих островах являются эндемиками (не встречаются больше нигде в мире) за счет процесса эволюционной дивергенции.

Кладогенез часто противопоставляют анагенеза, при котором постепенные изменения в предковых видах приводят конце концов к их «замены» новыми видами (т.е. при этом процессе нет почкования филогенетического дерева)