С

Строение ВИЧ

Геном и белки ВИЧ пристально изучаются со времени открытия вируса в 1983 Сам вирус был открыт примерно через два года после первого серьезного сообщение о СПИДе (в 1981).

Структура

Строение ВИЧ несколько отличается от других ретровирусов. Диаметр сферического вириона около 120 нм.

ВИЧ-1 содержит две копии одноцепочечной РНК, защищенной конической капсида, образованной p24, типичным для лентивирусив. РНК состоит из 9 749 нуклеотидов. Капсида, в свою очередь, окружена частью клеточной мембраны, которую вирус захватил при отходе от клетки, и содержащий также протеины ВИЧ ответственные за распознавание клеток. Одноцепная РНК прочно связана с белками нуклеокапсида, p6, p7 и энзимами которые необходимы для созревания вириона (обратная транскриптаза) и поражения клетки-хозяина (Интеграза). Нуклеокапсид (p7 и p6) ассоциированный с РНК (примерно 1 протеин на 6 нуклеотидов) и защищает ее от гидролиза нуклеазами. A matrix composed of an association of the viral protein p17 surrounds the capsid, ensuring the integrity of the virion particle. Также содержатся в вирионной Vif, Vpr, Nef, p7 и вирусная протеаза. The envelope образуется когда капсида отделяется от клетки и прихватывает часть клеточной мембраны. The envelope содержит гликопротеин gp120 i gp41.

Через роль в присоединении к клетке, структура выступления образованного gp120 и gp41, особенно важна.

Организация Генома

ВИЧ содержит несколько генов, кодирующих структурные белки типичные для ретровирусов и несколько неструктурных («accessory») генов что являются уникальными для ВИЧ. Ген gag кодирует полипептид, затем разрезается на основные структурные протеины. Ген pol кодирует белки ответственны за репродукцию вируса. Другие белки отвечают за вхождение в клетку и увеличивают репродукцию вируса. Все гены за исключением tev присутствуют во всех известных штаммах ВИЧ.

  • gag (англ. group-specific antigen): кодирует полипротеина Gag, что разрезается течение матурации вириона на MA (matrix protein, p17) CA (capsid protein, p24) SP1 (spacer peptide 1, p2) NC (nucleocapsid protein, p7) SP2 (spacer peptide 2, p1) and p6.
  • pol: кодирует энзимы вируса обратная транскриптаза, Интеграза, ВИЧ протеазы.
  • env (от «envelope», конверт): кодирует gp160, прекурсор gp120 и gp41, протеины находящихся на вирусной оболочке (viral envelope) и отвечают за связывание с поверхностью клетки.
  • Трансактиватор: tat, rev, vpr
  • Другие регуляторы: vif, nef, vpu
  • tev: присутствует только в нескольких штаммах. Представляет собой комбинацию частей tat, env и rev генов, кодирующий белок с некоторыми свойствами tat, но без активности типичной для rev.
Сокращение Описание Функции
gp41 (TM, transmembrane) трансмембранный гликопротеин массой 41 кДа Находится на внешнем слое липидной мембраны. Играет роль «якоря», для другого белка — gp120
gp120 (SU, surface) гликопротеин массой 120 кДа Внешний белок вириона. Нековалентно связан с трансмембранным белком gp41. (до одного gp41 присоединены 3 — 5 молекулы gp120. Отвечает за связывание с CD4 рецептором. Играет ключевую роль в проникновении вируса в клетку.
p24 (CA, capsid) белок массой 24 кДа образует оболочку капсида вируса
p17 (MA, matrix) Матричный белок массой 17 кДа Порядка 2000 молекул MA образуют слой толщиной 5 — 7 нм, между внешней оболочкой и капсида вируса.
p7 (NC, nucleocapsid) Нуклеокапсидных белок массой 7 кДа Входит в состав вириона (~ 2 000 молекул) образуя комплекс с вирусной РНК.

Структура РНК

Геном ВИЧ содержит несколько вариативно устойчивых (conserved) элементов вторичной структуры. В частности 55-нуклеотидную последовательность трансактивации (TAR, trans-activating responsive) (TAR) на 5 'конце генома (некодирующей протеины) и HIV Rev response element (RRE) внутри гена env. Роль всех элементов вторичной структуры РНК ВИЧ известна не полностью, однако она несомненно играет важную роль в жизни и размножении вируса. Например, «шпильки» SL2 и SL3 распознаются NC (p7) частью протеина GAG при сборки новых копий вируса на внутренней части клеточной мемебраны.

Структуру полного генома ВИЧ-1 было недавно установлено (single-nucleotide resolution).

Изображения по теме

  • Строение ВИЧ
  • Строение ВИЧ
  • Строение ВИЧ
Показать больше

Похожие статьи

Добавить комментарий

Проверьте также
Закрыть
Кнопка «Наверх»
Закрыть
Закрыть