Т

TATA-бокс

TATA-бокс (бокс Гольдштейна-Гоґнесса) — ​​последовательность промоторной участка большинства (но не всех) генов еукароиот и архебактерий. Обычно расположена в позиции -25 относительно точки начала транскрпипции. К TATA-бокса присоединяются общие факторы транскрпиции, таким образом он участвует в определении места и частично направлении транскрипции. Аналогичная по функциям участок у бактерий называется бокс Прибнова.

История исследования

TATA-бокс был открыт 1979 Гоґнессом при сравнении 5'-фланукючих последовательностей белок-кодирующих генов дрозофилы, млекопитающих и вирусов эукариот. Почти во всех генов, которые транскрибируются РНК-полимеразы II, была обнаружена последовательность TATAAA в положении 25-30 нуклеотидов до точки начала транскрипции. TATA-бокс также был обнаружен в Saccharomyces cerevisiae, однако в положении -40 — -120.

С развитием методов трансфекции и in vitro транскрипции удалось установить, что мутации в этой последовательности обычно приводят к уменьшению или полной исчезновения активности промотора. В тех случаях, когда активность оставалась, обычно наблюдалось смещение точки начала транскрипции.

Распространение

Первые представления о том, что TATA-бокс может быть строго консервативной последовательностью, необходимой для инициации транскрипции во всех эукариот, не нашли подтверждения, поскольку было обнаружено много генов лишенных его. Различные анализы генома дрозофилы показали, что консенсусной последовательность TATAAA или последовательность с изменением одного нуклеотида содержат от 33% до 43% промоторов. У человека 32% с 1031 потенциального промотора содержали TATA-бокс.

По крайней мере в некоторых генах ТАТА-бокс был обнаружен во всех исследованных животных, растений и грибов, а также многих архей. Лишенные такой последовательности некоторые древние паразитические простейшие.

Функционирование

Консенсус последовательность TATA-бокса: 5'-ТАТА (А / T) А (А / T) -3 ". Он распознается белком TBP (англ. TATA-binding protein), который входит в состав общего фактора транскрипции TFIID (транскрипционный фактор D для РНК-полимеразы II). Кроме TBP TFIID содержит также около TBP-ассоциированных факторов (англ. TBP-associated factors, TAFs).

TBP — один из древнейших и важнейших транскприпцийних факторов, он очень мало изменился в течение эволюции. ДНК-связывающая участок этого белка имеет форму седла, каждая половина представлена ​​5-цепной антипараллельно β-структурой. Восемь из десяти β-цепей благодаря гидрофобным взаимодействиям связываются с малым желобком двойной спирали ДНК. Присоединение TBP к ДНК вызывает ее деформацию и изгиб, что способствует различию двух ее цепей. Различие также облегчается тем, что TATA-бокс почти всегда состоит только из пар нуклеотдиив А-Т, между которыми образуется только два водородные связи, в противовес Г-Ц парам, азотистые основания в которых соединены тремя связями. Деформация ДНК и различия ее цепей служит «пометкой" активного промотора и способствует присоединению других факторов транскрипции.

Показать больше

Похожие статьи

Добавить комментарий

Проверьте также
Закрыть
Кнопка «Наверх»
Закрыть
Закрыть